تتراوح تكلفة عملية الحقن المجهري بشكل كبير من مكان إلى آخر وتعتمد على عدة عوامل، و يمكن أن يبدأ متوسط سعر عملية الحقن المجهري من 50 ألف جنيه مصري، و إليك بعض العوامل التي تؤثر على هذه التكلفة:
- خبرة الطبيب ودرجته العلمية.
- جودة التقنيات الطبية المستخدمة.
- مستوي الخدمة الطبية التي يحصل عليها المريض.
- الحالة الصحية للمريض.
- التحضيرات التي يتم الخضوع إليها قبل اجراء العملية.